从事生物信息学方面的研究工作，构建了基于Illumina技术的二代测序数据分析平台，提出了第二代测序数据质量控制的标准及其软件,用于多个基因组和转录组项目，包括发表于nature的国际西红柿基因组。主持编写了国内第一本R语言芯片与高通量测序数据分析的专著。首次提出基因打分矩阵的支持向量机预测蛋白质点突变效果。2013年，在第三届国际微生物大会首次提出基于高通量sRNA测序检测人类病毒的方法。2016年发表文章，首次在国际上提出动物线粒体Dloop区域存在两条长非编码RNA。已经发表学术论文51篇，其中SCI收录30篇，包括Nature，Nature genetics和PNAS文章（不是第一或通讯作者），一篇论文入选2015年度英国皇家化学会Top1%高引论文。主持编写生物信息学专著两部，两项软件著作权和两项发明专利（审核中）。根据权威学术排名网站ResearchGate的评测（2016年12月12日），RG score为27.51超过82.5%的研究人员。