1986 年至1993 年任北京农业大学植物病理系助教、讲师，主要从事疫霉及食线虫真菌研究；1993 年至2001 年在中国农业科学院生物防治研究所任助研、副研（95）、副所长（95－97）、研究员（2000），主要从事食线虫真菌及生物防治研究；1997 年至1999 年在美国明尼苏达大学做博士后，主要从事大豆胞囊线虫生物防治研究；2001 年至今在中国科学院微生物研究所任研究员、真菌与地衣系统学院重点实验室主任（2001－2010）、真菌学国家重点实验室主任（2011－）。主要从事特殊环境真菌群落及真菌与线虫/昆虫协同进化研究。发现2 个新属、48 个新种，23 个新组合；建立了Datylella 及相关属的更趋于自然的分类体系；通过多基因分析阐明了捕食真菌系统进化的规律及各类捕食器官的起源与分化时间。分离了鉴定了洛斯里被毛孢致病相关蛋白及其基因；建立了被毛孢的实时荧光定量PCR 检测技术并明确了土壤因子对被毛孢定殖和增殖的影响。另外，还率先在国内开展了特殊环境如低温、湿地、岩石、冬虫夏草真菌群落研究。已经培养博士后4 名、博士9 名、硕士8 名，正在指导博士和硕士研究生12 名，博士后4 名。获得包括2004 年国家科技进步二等奖等5 项科技奖。1997 年被评为农业部―有突出贡献中青年专家， 国务院政府特殊津贴获得者。在PNAS、BMC Evol Biol、PLoS One、FEMS Microbiol Ecol、Mycol Res、Mycologia、FEMSMicrobiol Let、Biol Control 等SCI 收录刊物上发表70 余篇论文。 目前担任中国菌物学会理事长、法人代表（2011－2014）；亚洲菌物学会主席（2011－2015）；美国线虫学会生防委员会委员（2007－2011）；中国植物病理学会理事会常务理事（2006－2015）；山东省应用微生物重点实验室学术委员会主任、云南省生物资源保护与利用重点实验室学术委员会副主任；微生物研究所、真菌学国家重点实验室、 天然药物活性物质与功能国家重点实验室、农业部植物病理学重点实验室、安徽省微生物生物防治重点实验室等学术委员会委员；中国科技大学、中国农业大学、西藏大学农牧学院兼职教授；《Mycology》 主编，《中国植物病理学报》、《菌物学报》副主编，《生物多样性》、《菌物研究》、《中国生物防治学报》编委、中国科协第八届全国委员会委员。