杨剑,男,1977年5月生,理学博士,中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所研究员。1999年毕业于南京大学基础学科强化部生物物理专业,2004年获得中国科学院生物物理研究所理学博士学位。长期从事病原微生物相关的生物信息学研究,重点聚焦于病原细菌毒力因子的遗传多样性特征这一关键科学问题。通过大数据整合与挖掘,推出通用分类方案,开发毒力因子在线识别系统和卷积神经网络分类模型,成功建立国际上最大的病原细菌毒力因子数据平台,并揭示了细菌细胞外可伸缩注射系统和毒素复合体等多种毒力因子的物种分布、进化分型和毒力结构域等特征。近年来主持承担国家973计划、国家重点研发计划、国家自然科学基金、和梅琳达•盖茨基金会等多项科研项目。已作为第一或通讯作者(含并列)发表SCI论文30篇,影响因子合计超过200,截至目前累计被同行引用3,200余次,以此30篇论文计算的H-index指数为19。其中,病原细菌毒力因子数据平台相关三篇论文位列ESI高被引论文,一篇入选“2019年中国百篇最具影响国际学术论文”,另有两篇其他研究论文获得F1000推荐。2009年入选北京市科技新星计划(A类),2011年入选协和新星。
工作经历
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中国医学科学院病原生物学研究所
研究员, 2010-01至现在
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中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
病毒基因工程国家重点实验室, 助理研究员/副研究员, 2004-08至2009-12
教育经历
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南京大学
生物物理学, Bachelor, 1995-08至1999-07