基于转录组测序的云南‘火把梨’花青素相关基因分析

作者：王大玮^*; 沈兵琪; 周凡; 周军

来源：分子植物育种, 2019, 17(06): 1788-1795.

DOI：10.13271/j.mpb.017.001788

• 梨
• 花青素
• 转录组
• 功能注释

本研究以云南‘火把梨’转色前后的梨果皮为试验材料,采用高通量测序技术(Illumina HiSeq TM 2000/MiSeq)对两种梨材料全转录功能基因组测序后组装,再通过GO、Swiss-Prot两大数据库进行花青素相关差异表达基因筛选,以了解可能与花青素合成相关的基因及其表达模式,同时将差异基因在NCBI数据库进行Blast序列比对,对其功能进行分析。最终共获得7.52 Gb数据,组装过滤后共获得75 227 538条Clean reads,3 920条差异表达基因,通过通路分析和Pathway功能注释,在花青素合成过程中的两条通路中共注释到30条与花青素合成相关的差异表达基因,初步对这些差异基因的功能进行鉴定和分析,对后期基因克隆及转基因等研究具有重要意义。

• 单位
  西南林业大学; 北方民族大学