“金手指”香蕉抗枯萎病基因同源序列的克隆与分析(英文)

作者：孙德权; 胡玉林; 张鲁斌; 莫亿伟; 谢江辉

来源：分子植物育种, 2009, 7(06): 1215-1222.

• 香蕉
• 枯萎病
• 抗病基因同源序列
• 核苷酸结合位点

本研究以抗镰刀菌枯萎病香蕉种质"金手指"(AAAB)为材料,根据已克隆的抗枯萎病基因的 NBS保守结构域设计简并引物,通过同源序列克隆获得了 20 条来自基因组 DNA 的 RGA 片段,大小为 530 bp 左右。根据其推断的氨基酸序列,经保守结构域分析,其结构域均为 NB-ARC,属于 non-TIR-NBS 类候选抗病基因类序列。它们均具有 P-loop (GMGGVGKTT),Kinase-2 (LLVLDDIW),RNBS-B (CKVLFTTRS)以及疏水氨基酸结构域 GLPL (GLPLALKVL)等 4 个保守氨基酸基元。20 个 RGA 之间核苷酸序列的相似性在 41.1%～99.3%之间,氨基酸序列的相似性在 33.2%～96.3%之间。同时,对分离得到的 20 条 RGAs 进行系统发育树分析,发现它们分布在 5 个不同的区域。并且所编码的氨基酸序列与已知抗枯萎病基因 Fom-2、I2C-1、I2C-2和 I2 等编码的氨基酸序列表现出 28%～54%的同源性,证明了抗病基因在进化上具有一定的保守性。因此,这些抗病基因同源片段(RGA)的分离将为进一步从香蕉中分离抗枯萎病基因打下基础,也可作为分子标记筛选香蕉抗枯萎病的候选基因。

• 单位
  中国热带农业科学院南亚热带作物研究所