帕金森病的生物信息学分析及潜在治疗中药的预测

作者：赵佳佳; 木尼热·艾海提; 张宇洁; 杨俊玲; 叶红霞; 许忠^*

来源：中国医药导报, 2021, 18(21): 23-198.

• 帕金森病
• 生物信息学
• 中药
• 分子对接

目的对帕金森病(PD)差异表达基因进行生物信息学分析,并预测潜在治疗中药,为PD的防治提供新的研究方向和思路。方法采用GEO2R分析PD数据集(GSE22491)、(GSE54536),获得差异基因,利用String进行蛋白质-蛋白质相互作用网络构建,并进行GO和KEGG分析,构建靶点-信号通路网络图,筛选PD发展中的关键基因及潜在病理机制,运用中药系统药理学数据库与分析平台、Coremine Medical平台筛选潜在治疗中药,并进行分子对接。结果筛选出576个显著差异基因,其中有428个基因表达上调,148个基因表达下调。显著基因有SRC、MAPK14、HSP90AA1、TNF、CXCR4、GRIN1,主要富集在PI3K-Akt、Tight junction、Neuroactive ligandreceptor interaction等信号通路上,潜在治疗中药有虎杖、雷公藤、沙棘等。结论 576个PD关键基因产生抗菌消炎、改善血液循环、增强免疫、减轻脑组织神经介质的代谢紊乱等作用,达到治疗效果,为PD的临床治疗提供参考依据。

• 单位
  乌鲁木齐市中医医院