多发性骨髓瘤预后相关自噬基因筛选及建模

作者：张钧栋; 卢迪; 张皓旻; 陈浩然; 王紫宁; 卢学春^*

来源：生物信息学, 2023, 21(02): 114-120.

• 多发性骨髓瘤
• 自噬相关基因
• 预后

为探讨自噬相关基因(ARGs)在MM发生发展中的作用机制并建立相关的预后模型。基于MMRF与HADb数据库，通过R语言确定多发性骨髓瘤中自噬相关基因的差异表达，GO和KEGG分析自噬相关基因与多发性骨髓瘤发生发展的关系，使用COX回归算法建立多基因预后模型，Kaplan-Meier方法绘制生存曲线，ROC曲线评价预后模型的可靠性。最终从764例多发性骨髓瘤患者骨髓样本及4例正常骨髓样本中共发现104个基因的表达在多发性骨髓瘤样本中具有显著差异，其中上调基因46个，下调基因58个。GO富集主要集中在巨自噬、自噬调节、细胞对外部刺激的反应等本体学注释。KEGG富集主要集中在自噬、细胞凋亡、NOD样受体信号通路、PI3K-Akt信号通路。单因素COX分析发现33个自噬相关基因与多发性骨髓瘤患者整体生存明显相关。多因素COX回归筛选出13个预后相关自噬相关基因(NKX2-3、NCKAP1、BIRC5、PEX3、HGS、RUBCN、PARP1、ARSA、DNAJB9、HSP90AB1、EEF2、FKBP1B和CD46)建立多发性骨髓瘤自噬相关基因预后模型。Kaplan-Meier生存曲线分析显示，高、低风险组患者的生存率具有显著差异(P<0.001),多因素COX回归分析表明，年龄、ISS分期和风险值是多发性骨髓瘤患者的独立预后指标(P<0.05),ROC曲线下面积分别为0.561、0.685和0.719。得出如下结论：多发性骨髓瘤自噬相关基因预后模型可用于预测多发性骨髓瘤患者的生存情况，但需进一步的临床研究加以证实。

• 单位
  解放军总医院; 山西医科大学