基于Simion软件首先对线型离子阱电极进行了建模、配置了电极电压、设置了离子运动初始条件,然后模拟仿真了离子在阱内的运动情况。仿真结果表明,离子能否在阱中心稳定囚禁由电极间的相对位置、电极上加的射频电压幅值、离子发射的初始条件等因素决定,仿真结果与相关文献中的理论分析基本吻合。最后根据大量的仿真实验结果对电极尺寸、电极电压等工作参数进行了优化,仿真结果对后期离子阱实验装置的机械设计和囚禁实验参数的选取具有重要指导意义。