铁皮石斛羟基肉桂酰基转移酶基因家族生物信息学及其表达分析

作者：龙小琴; 聂聪; 何基泽; 田野; 李昕燃; 皮鑫瑶; 王万军; 朱乾坤^*

来源：福建农业学报, 2022, 37(04): 492-502.

DOI：10.19303/j.issn.1008-0384.2022.004.010

• 铁皮石斛
• 羟基肉桂酰基转移酶
• 表达分析
• 黄酮类化合物
• 石斛酚

【目的】对铁皮石斛HCT(Hydroxycinnamoyl transferase)基因家族进行特征鉴定和表达模式分析，为研究铁皮石斛黄酮类化合物和石斛酚的生物合成奠定研究基础。【方法】通过NCBI在线网站获得铁皮石斛的基因数据信息，利用生物信息学方法分析铁皮石斛DoHCT基因家族成员系统进化树、DoHCTs保守基序和保守结构域，并且预测DoHCT家族成员的蛋白二级和三级结构；同时利用逆转录PCR的方法分析DoHCTs在不同胁迫条件下以及在根茎叶中的差异表达情况。【结果】铁皮石斛DoHCTs共有8个家族成员(DoHCT 1～8)，保守结构域分析结果显示：DoHCT7～8属于转移酶超家族，DoHCT 1～6属于PLN02481超家族。该家族基因的表达可受到非生物胁迫不同程度的影响，其中高温条件下DoHCT家族基因均下调表达；组织表达检测结果显示除DoHCT7外，其余基因均在根茎叶中差异表达。【结论】在全基因组水平对DoHCT家族进行了系统的生物信息学分析，显示DoHCTs在不同胁迫下以及铁皮石斛根茎叶中存在差异表达，证实其在非生物胁迫应答中起到调控作用。

• 单位
  西南交通大学