西藏部分地区12株藏族人群C/D重组型乙肝病毒全基因序列分析Whole-sequence Analyses for 12 HBV C/D Recombinants from a Population in Tibet (China)

作者:刘铁柱; 沈立萍; 尹文娇; 王锋; 王富珍; 张国民; 郑徽; 顿珠多吉; 张爽; 毕胜利; 崔富强LIUTiezhu; SHEN Liping; YIN Wenjiao; WANG Feng; WANG Fuzhen; ZHANG Guomin; ZHENG Hui; DUNZHU Duoji; BI Shengli; CUI Fuqiang
来源:病毒学报, 2016, (02): 156-160.

摘要

为了解藏族人群中流行的乙型肝炎病毒(HBV)基因型及基因重组状况,收集藏族人群HBsAg阳性样本,提取HBVDNA并用巢氏PCR的方法扩增HBV全长序列,测序后用DNAstar 软件拼接全基因序列,进一步利用MEGA6和Simplot软件进行序列同源性和系统进化分析。应用该方法获得12株藏族人群HBV全基因序列,分析结果显示12株样本为C/D重组型,其中9株样本的重组位点位于nt750,3株样本的重组位点位于nt1526,以此可分为两种重组方式,分别命名为C/Da和C/Db;从总体序列同源性来分析12株样本均属于C基因型,且与现有的C1-C15亚型的核苷酸差异均大于4%,与C1亚型最为接近。从...