甜菜热激蛋白基因BvHSP18.2的克隆和生物信息学分析

作者：张琼; 王锦霞; 孟诗琪; 钟鑫爱; 刘大丽; 兴旺^*

来源：中国农学通报, 2022, 38(27): 111-118.

• 甜菜
• 小分子热激蛋白
• BvHSP18.2
• 基因克隆
• 生物信息学分析

旨在通过基因克隆及生物信息学分析，预测甜菜小分子热激蛋白BvHSP18.2 (LOC104903994)的功能。以甜菜‘780016B/12 优’为试验材料克隆 BvHSP18.2，获得 BvHSP18.2 基因全长；通过 ProtParam tool、SWISS-MODEL、MEGA11 等对 BvHSP18.2 的理化性质、蛋白结构、多序列比对等信息进行分析。RT-PCR 扩增得到的 BvHSP18.2 基因全长为 962 bp，编码 158 个氨基酸，分子式为 C928H1466N266O284S6，属亲水性不稳定的小分子热激蛋白家族；该基因编码蛋白含13个磷酸化位点，α螺旋和无规则卷曲等主要构件。进化关系发现BvHSP18.2与藜麦、菠菜的s HSP同源性相似。同时，BvHSP18.2基因启动子区域具有参与防御和应激反应等顺式作用元件，推测其在甜菜生长发育和胁迫应答中发挥重要作用。本结果为进一步开展该基因的功能和遗传调控机制研究奠定了基础。

• 单位
  生命科学学院; 黑龙江大学