利用高通量测序技术鉴定棉纤维发育相关miRNAs及其靶基因

作者：南文智; 吴嫚; 于霁雯; 范术丽; 黄双领; 李兴丽; 张红卫; 张金发; 喻树迅

来源：棉花学报, 2013, (04): 300-308.

• 棉花miRNA
• 高通量测序
• 棉花D5基因组
• 靶基因预测 cotton miRNAs
• deep sequencing
• cotton D5genome
• target prediction

miRNA(microRNA)是一类21～24个核酸长度的非编码小分子RNA(sRNA),它主要通过抑制或降解靶基因来调控植物生长发育等过程。试验利用在纤维长度上有显著差异的2个回交自交系BILs(Backcrossinbred lines)的0 DPA(Days post anthesis)、3 DPA的胚珠和10 DPA的纤维构建6个sRNA文库并进行Solexa测序。以已公布的棉花D5基因组序列和棉属其他序列为参考,经分析共发现561个miRNAs,其中包括254个已知的miRNAs(属于40个miRNA家族),75个候选的miRNAs和232个新的miRNAs,研究结果极大地丰富了棉属...

• 单位
  中国农业科学院棉花研究所; 棉花生物学国家重点实验室; 西北农林科技大学