摘要
核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase, Rubisco)是植物光呼吸过程中的关键酶,在光合作用中决定了碳同化速率。本研究利用NCBI-Blast、ProtParam、ProtScale、TMHMM、Targetp、SOPMA、SWISS-MODEL、SignalP-5.0、PSORTⅡ、Promoter-2.0、STRING等在线软件,针对牡丹中核酮糖1,5-二磷酸羧化酶(PsRbc)蛋白进行生物信息学分析。结果表明,PsRbc蛋白由425个氨基酸组成,pI为6.60,分子量为47 088.56 kD,为稳定性较高的亲水性蛋白质;无信号肽区域,无跨膜结构,在细胞质中分布较多;二级结构分析表明PsRbc以α-螺旋和无规则卷曲为主;系统发育分析表明牡丹与艾菲拉草、美国省沽油、锐尖山香圆、台湾林檎的同源性最高,亲缘关系较近。对PsRbc编码蛋白进行生物信息学分析,获得了基因的特征及预测蛋白发挥的功能,为进一步开展牡丹功能基因研究提供了科学依据。
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