普通小麦籽粒硬度的全基因组关联分析

作者：胡文静; 张晓; 刘巧; 方正武; 高德荣^*

来源：麦类作物学报, 2021, 41(02): 157-163.

• 小麦
• 硬度
• 90K SNP
• 全基因组关联分析
• 品质育种

籽粒硬度是小麦品质评价的重要指标。为挖掘控制小麦籽粒硬度的重要基因/位点,以国内外171个小麦品种组成的自然群体为材料,在4个环境下利用小麦90K SNP芯片对籽粒硬度进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)。171个小麦品种籽粒硬度变异系数为56.59%～66.80%,相关系数为0.88～0.92。GWAS结果表明,共检测到20个与小麦籽粒硬度显著相关的SNPs,其中,14个SNPs(7个位点)在2个及以上环境中能被检测到,分别位于1A、1B、1D、2A、5A和7A染色体上,可解释6.76%～11.79%的表型变异。表型贡献率超过10%的SNPs有4个(3个位点),分布在1D、2A和5A染色体上,其中,1D染色体上的标记wsnpKuc1962229138795在3个环境中能被检测到,可解释9.08%～11.79%的表型变异;2A染色体上的标记Excaliburc126751789在4个环境中均能被检测到,可解释9.10%～10.86%的表型变异;5A染色体上的标记wsnpRac2470734262900和BS0004121951在2个环境中能被检测到,可解释6.76%～10.35%的表型变异。在所有环境下均与小麦籽粒硬度显著相关的位点有4个,分别位于1A、1B、2A和7A染色体上。

• 单位
  长江大学; 农业部; 扬州大学; 江苏里下河地区农业科学研究所