摘要
基因调控网络的重构是功能基因组中最具挑战性的课题之一.实验证明构建基因调控网络的最有前途的方法是贝叶斯网络.EM算法是一种有效的利用数据来学习贝叶斯网络的方法,能较好地处理构建基因调控网络中的数据缺失情况,但存在学习精度低、对初始参数值依赖的缺点.本文应用贝叶斯网络实现啤酒酵母细胞基因调控网络的构建,用改进的MS-EM算法进行学习,并实现实验结果的可视化.与现有文献比较,结果表明改进后的算法进一步降低了时间性能,提高了构建调控网络的精度.
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基因调控网络的重构是功能基因组中最具挑战性的课题之一.实验证明构建基因调控网络的最有前途的方法是贝叶斯网络.EM算法是一种有效的利用数据来学习贝叶斯网络的方法,能较好地处理构建基因调控网络中的数据缺失情况,但存在学习精度低、对初始参数值依赖的缺点.本文应用贝叶斯网络实现啤酒酵母细胞基因调控网络的构建,用改进的MS-EM算法进行学习,并实现实验结果的可视化.与现有文献比较,结果表明改进后的算法进一步降低了时间性能,提高了构建调控网络的精度.