基于加权基因共表达网络分析鉴定心房颤动发病的关键基因

作者：张德宝; 陈俊羽; 黄于朗; 阮焕钧; 李腾^*

来源：分子诊断与治疗杂志, 2023, 15(08): 1335-1343.

DOI：10.19930/j.cnki.jmdt.2023.08.012

• 心房颤动
• 关键基因
• 生物信息学

目的 鉴定房颤（AF）发病机制中的关键基因（Hub Gene）。方法 从GEO数据库中下载GSE161450作为训练集筛选差异表达基因，并通过系统加权基因共表达网络分析（WGCNA）寻找与AF相关的模块和候选基因。将差异表达基因与WGCNA中的性状模块基因取交集，获取Hub Gene，而后对Hub Gene进行基因功能注解（GO）和蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析。结果 共构建8个具有强保守性模块，其中MEbrown模块与AF显著相关，并鉴定出5个Hub Gene，分别为：超极化激活环状核苷酸门控通道2(HCN2)、亲离子型谷氨酸受体5(GRIK5)、乙酰胆碱受体E(CHRNE)、钾向内整流通道亚族J成员2(KCNJ2)和热休克蛋白家族成员2(HSPA2)。此Hub Gene主要聚集于GO:0034702离子通道复合体（ion channel complex）,GO:1902495跨膜转运体复合体（transmembrane transporter complex）和GO:1990351转运体复合体（transporter complex）三个通路。结论 WGCNA分析鉴定出与AF发病相关的5个Hub Gene可能有助于AF发病机制的阐述。

• 单位
  深圳市孙逸仙心血管医院; 中国医学科学院阜外医院深圳医院