科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
为探究不同植龄的对叶百部块根基因表达差异，本实验以同一产地同一品种的3个不同植龄对叶百部为研究对象进行转录组分析。共产生54 Gb clean base，拼接获得64 682个unigene，平均长度为1 183.45bp，在6大功能数据库(NR， GO， KEGG， Pfam， eggnog， Swiss-Prot)上都注释到的unigene 总数为5 798个。在表达差异倍数 |log2FoldChange| > ，显著性P-value<0.05的条件下，ST1和ST2的差异表达基因共有3 751个，其中上调的有1 040个，下调的有2 711个；ST1和ST3次之，共有3 541个，其中上调的有1 225个DEGs，下调的有2 316个；ST2和ST3共有1 922个DEGs，其中上调的有1 184个，下调的有738个。在KEGG分析中三个组别分别有638、602和281个DEGs代谢生物合成途径被注释到。本实验通过分析不同植龄对叶百部块根转录水平上的差异，有助于理解不同植龄对叶百部产量及化学成分含量等方面存在的差异，为后期开展对叶百部生长发育及相关功能基因解析提供基础信息。
- 单位
