宏基因组技术鉴定红原县儿童腹泻相关病毒

作者:宋哲; 敬琼; 杨贵生; 周燕; 张斌; 汤承; 岳华*
来源:西南民族大学学报(自然科学版), 2022, 48(02): 142-149.

摘要

病毒是引起儿童急性胃肠炎的主要原因,且种类较多.为了解四川省阿坝藏族羌族自治州红原县儿童腹泻病毒种类和分子特征,本研究于2019年4~11月从红原县采集12份急性胃肠炎儿童的腹泻粪便,采用病毒宏基因组学技术鉴定病毒种类,并从阳性样本中扩增病毒基因组.结果显示,从被检样本中鉴定出6种病毒:星状病毒(Astrovirus, AstV)、诺如病毒(Norovirus, NoV)、爱知病毒(Aichivirus, AiV)、柯萨奇病毒(Coxsackievirus, CAV)、札幌病毒(Sapovirus, SV)和腺病毒(Adenovirus, AdV),并成功获得了AstV-1b型、GⅡ.4型NoV和GIV.1型SV的基因组.本研究结果为红原县儿童腹泻病的防控提供了参考,丰富了青藏高原儿童腹泻相关病毒的分子特征和遗传进化资料.