高粱3 bp以上重复SSR标记开发及遗传多样性分析

作者：李金红; 张世睿; 董爽; 朱振兴; 张丽霞; 陆晓春

来源：分子植物育种, 2022, 1-11.

• 高粱
• SSR标记
• 遗传多样性

为了开展高梁不同品种和种质资源在分子育种工作，实现对高粱杂交种和优良种质资源快速精准鉴定。本研究利用26份高粱材料的重测序结果，经过生物信息学分析，筛选了单拷贝基因中不同位置的3 bp以上重复SSR标记4245对，随机选取均匀分布在10条染色体的标记1200对；经过初筛和复筛得到稳定性好、多态性高的SSR标记40对，同时利用这40对标记在43份高粱种质资源共扩增237个等位基因数，平均每个标记产生6.1个等位基因，开发的标记多态性信息(PIC)变异幅度为0.44～0.88，平均值为0.68；其基因的多样性指数(GD)为0.49-0.89，平均值0.72；最后再利用这些标记对94份高粱杂交种进行遗传聚类分析表明，其遗传相似系数变化范围0.75～0.98，当遗传相似系数0.98时仍不能区分H46L和H47L，该结果表明二者亲本的遗传背景十分接近，而H41L与其它93个杂交种均未聚类在一起，则表明H41L与其他杂交种的亲缘关系较远，本研究不仅为高粱种质资源遗传多样性分析提供理论依据同时也为杂交种种子纯度鉴定提供实用性分子标记。

• 单位
  辽宁省农业科学院; 沈阳大学