应用型本科院校水处理生物学课程面临如下困境:一是课程目标不清晰;二是教学与专业联系不紧密;三是内容多,课时少;四是重知识传授,轻思想教育。针对上述问题我们采取以下四项改革措施:一是明确课程目标,建立与专业培养能力的关联;二是整合教学内容,强调与其他课程的协调性;三是改革教学手段,构建线上/线下混合教学模式;四是融入"课程思政",强调立德树人。从而培养学生具备科学思维与工程素养,以及解决实际工程问题的能力。