科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
IQ67-DOMAIN(IQD)蛋白家族是一类钙调素靶点互作蛋白，其特征是有67个保守氨基酸残基组成的特异性中心结构域，简称IQ67结构域，在各种生物和非生物胁迫中发挥重要作用，通过鉴定分析该家族的结构特征来预测其功能．利用生物信息学方法从甘蓝基因组中鉴定结球甘蓝IQD基因，分析其保守结构域、基因结构、分子进化和转录组数据等信息．共鉴定出28个IQD基因，命名为Bo IQD1～BoIQD28，其不均匀地分布在9条染色体上．预测23个IQD蛋白亚细胞定位于细胞核中．系统发育树分析将结球甘蓝IQD蛋白分为4个类群（Ⅰ～Ⅳ），每个类群又可分为2个亚组．共线性分析表明，甘蓝和拟南芥之间有较高的同源性，大部分BoIQD基因在进化中受到纯化选择．转录组数据表明，Bo IQD基因具有组织表达特异性，大部分在叶片中的表达量最高；所有的Bo IQD蛋白都有一个共同的IQ域基序；21个BoIQD基因与拟南芥呈共线性关系．
- 单位
