黔产宽叶缬草叶绿体trnL-F,matK基因遗传关系的分析

作者：钱志瑶; 饶海; 曹旭林; 邓强; 杨宏; 徐昌艳; 覃容贵

来源：中国实验方剂学杂志, 2018, 24(05): 36-42.

DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.2018050036

• 宽叶缬草
• 序列分析
• 聚类分析

目的:探讨贵州省宽叶缬草在叶绿体基因trn L-F,mat K上的遗传关系。方法:利用trn L-F,mat K序列对宽叶缬草进行序列分析,运用Bioedit,MEGA 5.0软件计算贵州省宽叶缬草居群遗传距离,并进行聚类分析建立系统发育树。结果:不同居群宽叶缬草trn L-F序列长度为947985 bp,鸟嘌呤和胞嘧啶质量分数为35.92%36.55%,其中差异位点8个,变异位点5个,居群间的遗传距离为0.000 00.005 4,最小进化法(minimum-evolution,ME),最大似然法(maximum likelihood,ML),邻接法(neighbor-joining,NJ),非加权配对算数平均法(unweighted pair group method with arithmetic mean,UPGMA)4种聚类构树结果显示15(江口县官和乡泗渡村寨上组),18(江口县凯德镇育苗基地)号样品明显与大部分的宽叶缬草样品区分出来;不同居群宽叶缬草mat K序列长度为1 0801 088 bp,鸟嘌呤和胞嘧啶质量分数为35.19%36.64%,差异位点2个,变异位点1个,简约信息位点1个,居群间的遗传距离为0.000 00.000 9,ML,NJ,ME,UPGMA 4种聚类构树结果显示2(剑河县太拥乡太平村),5(剑河县岑松镇稿旁村),6(剑河县关么乡苗岭村),20(江口县闵孝镇渔凉溪村)号样品聚为一类,其余19份样品聚为一类。结论:贵州省宽叶缬草居群内trn L-F,mat K序列具有高度保守性。

• 单位
  贵州医科大学; 公共卫生学院; 贵阳市云岩区人民医院