浅色黄姑鱼Ⅰ型胶原蛋白α2(COL1A2)基因的克隆及表达分析

作者：荣华; 凌钰; 豆腾飞; 黄英; 王晓雯; 孔令富; 毕保良; 王金浩^*

来源：云南农业大学学报：自然科学版, 2023, 38(05): 786-794.

• 浅色黄姑鱼
• COL1A2
• cDNA克隆
• 表达分析
• 组织分布

【目的】通过克隆浅色黄姑鱼(Nibea coibor)Ⅰ型胶原蛋白α2 (COL1A2)基因，分析其分子特征、组织分布及表达差异，为鱼类胶原蛋白代谢机制研究奠定理论基础。【方法】通过cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术获得浅色黄姑鱼COL1A2基因全长序列，利用生物信息学分析方法对其进行系统分析，探讨其分子特征及组织表达谱。【结果】COL1A2 cDNA序列长5 826 bp，编码1 352个氨基酸。BLAST同源性比对和系统进化树分析表明：浅色黄姑鱼与大黄鱼(Larimichthys crocea)同属石首鱼科(Sciaenidae)，亲缘关系最近，且两者COL1A2的氨基酸序列同源性最高(96.60%)。生物信息学分析显示：COL1A2多肽链包含脊椎动物Ⅰ型胶原蛋白的所有特征，如相同的信号肽、C-前肽和N-前肽结构域以及三重螺旋结构域等。qRT-PCR结果显示：鱼鳔中COL1A2基因的表达显著高于其他组织(P<0.05)，且胶原蛋白在不同组织中的分布规律与其一致。【结论】本研究首次克隆了浅色黄姑鱼COL1A2基因(GenBank登录号：MK641513)，该基因的组织表达特异性是引起胶原蛋白差异化沉积的原因之一。研究结果有助于深入探究胶原蛋白的生物合成途径及调控机制。

• 单位
  云南农业大学; 襄阳职业技术学院