李时珍"脑为元神之府"学说的学术意义可分为三个方面:第一,明确提出"元神"的概念,拓展了中医学关于"神"的认识,揭示了人的神包含先天元神与后天识神两个领域。第二,"脑为元神之府"是中医和道家养生的纲领,养生之要在于调神,所谓调神就是排除识神的过度干扰,使元神的活动得以恢复。第三,元神这一概念的提出,说明中国学者最早认识现代心理学所说的"无意识"的存在,比弗洛伊德的学说早七百余年,是对心理学、特别是深层心理学的重要贡献。