亚洲棉(Gossypium arboreum L.)纤维次生壁加厚期NAC基因的鉴定与表达分析

作者：王中娜; 商海红; 陈婷婷; 巩万奎; 刘爱英; 李俊文; 石玉真; 龚举武; 葛群; 王琳; 李伟; 李鹏涛; 白志川; 于杰; 袁有禄

来源：棉花学报, 2016, 28(01): 52-64.

• 亚洲棉(G.arboreum L.)
• 棉纤维
• NAC转录因子
• 序列分析
• 结构分析
• 表达模式

基于亚洲棉29729条纤维相关EST(Expressed sequence tag)序列和亚洲棉基因组序列,并结合雷蒙德氏棉(G.raimondii)NAC(NAM/ATAF/CUC)转录因子家族的研究结果,利用生物信息学方法,鉴定出143个亚洲棉NAC转录因子家族基因;利用实时荧光定量PCR技术对30个NAC转录因子构建表达图谱,鉴定出7个基因在亚洲棉纤维细胞次生壁加厚期优势表达,进一步明确了它们在亚洲棉、雷蒙德氏棉和陆地棉中的表达模式差异。利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)技术克隆得到了3个NAC基因全长c DNA,将其命名为Ga NAC20、Ga NAC09和Ga NAC69,初步的生物信息学分析发现Ga NAC20和Ga NAC09基因均含有3个外显子和2个内含子,Ga NAC69含有4个外显子和3个内含子,为进一步研究奠定了良好基础。

• 单位
  农业部; 棉花生物学国家重点实验室; 中国农业科学院棉花研究所; 西南大学