环境化学物暴露对妊娠期糖尿病生物信息学的影响

作者：刘素琴; 崔静; 孙健平; 隋树淼^*

来源：山东医药, 2021, 61(13): 56-62.

• 妊娠期糖尿病
• 环境化学物
• 基因本体论
• BIOCARTA分析
• 蛋白互作网络

目的探讨妊娠期糖尿病(GDM)共同关联基因参与的富集进程及信号通路并进一步研究影响GDM的环境化学物质。方法从GEO数据库中获取GDM关联的基因,通过比较毒理基因组学数据库获取直接作用的GDM相关基因及化学物质,并筛选出二者共同的GDM关联基因。采用DAVID在线软件对GDM关联的基因进行基因本体论(GO)分析和BIOCARTA信号通路分析,采用String在线软件和Cytoscape软件对GDM关联的基因进行蛋白互作网络分析。结果共发现有59个与GDM关联的基因。GO分析显示与GDM关联的基因主要集中在细胞外基质组织、血管再生、胚胎肢体形态发育、单生物细胞-细胞黏附以及细胞外区域等;BIOCARTA信号通路富集分析显示GDM共同的关联基因主要参与了IL-10抗炎信号通路、Ghrelin信号通路。蛋白互作网络分析显示GDM共同的关联蛋白共有6个模块,影响各个模块的环境化学物质主要为砷、莠去津、镉、二嗪农、二甲双胍、农药等。结论环境化学物质能在基因/蛋白水平上影响GDM的发生发展。

• 单位
  青岛市妇女儿童医院; 青岛市疾病预防控制中心