基于SLAF-seq技术开发芋肉纤维颜色性状的分子标记

作者：孙亚林; 王直新; 季群; 刘玉平; 黄新芳; 朱红莲; 柯卫东^*

来源：中国蔬菜, 2021, (06): 49-54.

DOI：10.19928/j.cnki.1000-6346.2021.1018

• 芋
• 纤维颜色
• SLAF-seq
• 分子标记
• 等位特异性PCR

紫色的芋肉纤维因其潜在的保健功能而深受市场欢迎,被认为是重要的品质性状。本试验以芋肉纤维紫色的荔浦芋为母本,以芋肉纤维黄色的乐平野芋为父本构建F2分离群体,利用特异长度扩增片段测序(specific length amplified fragment sequencing,SLAF-seq)技术结合集群分离分析法(bulked segregant analysis,BSA),开发与芋肉纤维颜色连锁的分子标记。结果表明:通过SLAF-seq技术共获得有效reads为37.65 Mb,开发出293?363个高质量的SLAF标签,获得SNP位点57?710个。利用SNP-index进行关联区域内2个亲本之间的SNP分析,获得了27个与芋肉纤维颜色性状紧密关联的SNP位点。设计特异引物进行等位特异性PCR(allele specific PCR,AS-PCR)验证SNP位点的多态性,其中Marker44764能对芋肉纤维颜色进行有效的基因分型。本试验建立了一套快捷简便的芋的基因分型方法,可用来对材料进行苗期的分子标记辅助选择,进而提高芋育种效率。

• 单位
  武汉市农业科学院