HDAC抑制剂SB939抑制三阴性乳腺癌细胞相关基因芯片分析

作者：王宝祯; 凌珺; 陈静; 李涛^*

来源：宁夏医科大学学报, 2022, 44(04): 392-399.

DOI：10.16050/j.cnki.issn1674-6309.2022.04.012

• SB939抑制剂
• 三阴性乳腺癌
• 基因芯片
• 靶向治疗

目的 通过基因芯片技术分析三阴性乳腺癌细胞经SB939抑制剂作用后基因的差异表达。方法 选三阴性乳腺癌细胞MDA-MB-231接种于培养皿中培养；待细胞贴壁后，用不同浓度的SB939(0、40、60μmol·L-1)处理24 h，将收集的细胞分为3个对照组C(未经SB939处理C1～C3)及6个实验组T(低剂量组T1～T3及高剂量组T4～T6)进行RNA的提取和纯化；随后与基因芯片杂交并进行芯片图像分析，以差异≥1.5倍的标准筛选差异表达基因。结果 与对照组相比，经HDAC抑制剂SB939高剂量处理后，根据基因芯片得到的数据并分析差异表达基因，其中表达上调1.5倍的基因19个，表达下调1.5倍的基因92个；通过GSEA分析，miR-501、miR-23A、miR-23B等miRNA在表达下调基因中显著富集；通过GO富集分析发现，下调的DEGs主要富集在唾液腺形态发生发展、受体结合、蛋白结合、细胞外空隙、血小板α颗粒管腔、肌动蛋白丝等；通过KEGG通路富集分析，下调DEGs通路主要富集于上皮细胞的细菌侵袭途径，磷酸肌醇代谢、磷脂酰肌醇信号系统及ECM-受体相互作用途径。结论 基因芯片技术能快速有效地检测SB939抑制剂抑制三阴性乳腺癌细胞后相关基因、miRNA基因表达水平及相关信号通路的改变，为乳腺癌精准治疗提供理论依据。

• 单位
  宁夏医科大学总医院; 基础医学院; 宁夏医科大学