太平洋西部鳓鱼隐蔽种的界定及系统发育关系重建

作者：王倩; 李晨虹^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(12): 5481-5487.

DOI：10.13417/j.gab.039.005481

• 鳓鱼
• 隐蔽种
• GMYC
• 线粒体基因组
• 系统发育关系

鳓鱼(Ilisha elongata)属于鲱形目(Clupeiformes),是锯腹鳓科的鱼类之一,鳓鱼目前在世界上主要分布在太平洋西部和沙捞越爪哇海海域。本研究报道了来自丹东和烟台的鳓鱼完整的线粒体基因组序列。线粒体基因组长度为16 809 bp,包括13个蛋白编码基因、22个tRNA、2个rRNA、12S rRNA、16S rRNA和控制区D-loop基因。本研究还对上述2个地点的6尾鳓鱼,利用完整的线粒体基因组以及非洲鳓作为外群重建了系统发育关系。结果显示,来自丹东和烟台的鳓鱼群体分成两个姊妹关系的单系群。用物种界定的方法(基于BEAST的GMYC模型)对丹东鳓鱼群体有较好的划分,研究显示丹东鳓鱼群体是太平洋西部的隐蔽种。由此推断,丹东鳓鱼群体隐蔽种的形成很可能是更新世冰期海平面下降产生了地理隔离以及后续长时间的基因交流障碍的结果。

• 单位
  上海海洋大学