基于GEO数据库筛选银屑病和克罗恩病差异基因及生物信息学分析

作者：李向真; 余茜; 杨亚鹏; 陈楠

来源：医药论坛杂志, 2023, 44(22): 11-16.

• 银屑病
• 克罗恩病
• GEO
• WGCNA
• 差异表达基因

目的 利用公共数据库的生物信息学分析，筛选银屑病和克罗恩病共有的关键致病基因及其生物学过程和通路，探索共有的基因特征和潜在分子机制。方法 从GEO数据库中搜索2002年8月—2022年8月期间数据集，并下载银屑病和克罗恩病的微阵列数据集，通过差异表达基因(DEGs)分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA)来筛选银屑病和克罗恩病相关的共有模块致病基因，并进行基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果 共筛选出FCGR3A、FCGR3B、CXCR2、MMP1、CXCL1、IDO1共6个枢纽基因。富集分析显示集中在细胞因子介导信号通路、免疫系统过程，KEGG中富集到的IL-17信号通路。结论 基因FCGR3A、CXCL1、IDO1、MMP1可能是银屑病和克罗恩病共病发生发展机制中的关键靶点。

• 单位
  郑州人民医院; 河南中医药大学