APOBEC3家族蛋白的进化分析和3D结构比对分析

作者：顾卫国; 吴宏宇; 劳亭嘉; 黄青山

来源：复旦学报(自然科学版), 2008, (05): 612-619.

DOI：10.15943/j.cnki.fdxb-jns.2008.05.007

• HIV-1
• SIV
• APOBEC3家族蛋白
• mtDNA
• 贮主
• 进化分析 HIV-1
• APOBEC3 family proteins
• reservoir
• phylogeny

为探寻HIV-1的种间传播路线与范畴进而发现有效的控制物,选取灵长类天然抗病毒因子APOBEC3家族的22种蛋白(以A3G为主)与17例灵长类线粒体(mtDNA)全基因组序列做进化分析研究.结果一致显示除黑猩猩(Pan troglodytes troglodytes,以下简称Pan),大猩猩(Gorilla)以外,猩猩(Pongo)中的某些种也可能是HIV/SIV的贮主或宿主,值得从实践中有目的追溯.不同种属A3G蛋白活性位点与Zn2+结合位点的3D结构比较结果显示人与其他灵长类物种极为相似,预示着A3G蛋白在结构和功能上是非常保守的.人的APOBEC3蛋白有A~H 7种,对它们的活性位点和Z...

• 单位
  遗传工程国家重点实验室; 复旦大学; 生命科学学院; 上海高科联合生物技术研发有限公司