2015—2017年东北地区猪星状病毒ORF1b基因分子流行病学调查

作者：杨丹; 张备; 朱金海; 翟军军; 孔凡志; 孙东波^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2019, (13): 70-88.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2018.06.0309

• 猪星状病毒
• ORF1b基因
• 腹泻
• 半巢式RT-PCR
• 系统进化分析

为了解2015—2017年东北地区猪星状病毒(Porcine astrovirus,PAstV)流行情况,试验采用半巢式RT-PCR方法对2015—2017年东北地区的122份仔猪小肠及粪便样品(107份来自腹泻仔猪,15份来自健康仔猪)进行PAstV检测,对阳性产物进行测序,并对测序结果进行同源性分析及构建系统进化树。结果表明:半巢式RT-PCR扩增得到大小约为422 bp的片段,样品总阳性率为9.02%(11/122),其中腹泻仔猪样品的阳性率为10.28%(11/107),健康仔猪样品的阳性率为0(0/15);有4株PAstV ORF1b基因测序成功;毒株间核苷酸同源性为99.1%～100%,氨基酸同源性为97.4%～100%;与PAstV 2型参考毒株核苷酸的同源性最高,为75.9%～92.3%;获得的4株PAstV均属于PAstV 2型。说明东北地区有PAstV的流行,且以PAstV 2型为主。

• 单位
  黑龙江八一农垦大学; 动物科技学院