基于稳定同位素标记与质谱分析的蛋白质定量算法研究进展

作者：杨星; 张纪阳; 朱云平; 谢红卫

来源：分析化学, 2009, (01): 144-151.

• 定量蛋白质组
• 质谱
• 稳定同位素标记
• 定量算法
• 评述 Quantitative proteomics
• mass spectrometry
• stable isotope labeling
• quantitative algorithm
• review

蛋白质定量研究已成为蛋白质组学的热点,它是疾病相关生物标志物发现的重要途径。基于稳定同位素标记的质谱分析技术是蛋白质定量最常用的方法之一。随着实验方法的发展和改进,定量数据处理方法也在不断更新与完善。一般来说,定量数据处理包括四步:搜库鉴定、图谱定量信息提取与计算、肽段丰度比计算和蛋白质丰度比计算及差异显著性分析,其中后三步是数据处理的核心。目前,后三步中每步都有多种可选算法,这些算法一般都是针对特定实验技术而提出的,缺乏深入的工作对它们进行系统比较和优化。为此,在总结目前主要实验技术方法的基础上,论述了定量算法的现状和存在问题,并针对一些问题提出了可行的解决办法。

• 单位
  军事医学科学院放射与辐射医学研究所; 蛋白质组学国家重点实验室; 北京蛋白质组研究中心; 自动化学院; 国防科学技术大学