基于生物信息学方法筛选精原细胞瘤进展中的脂代谢关键基因

作者：闫墨; 刘帅兵; 王楷斌; 陈铭哲; 杨阔^*

来源：天津医科大学学报, 2022, 28(06): 585-597.

• 精原细胞瘤
• TCGA
• 脂质代谢
• FABP1
• 免疫浸润

目的：通过生物信息学方法筛选精原细胞瘤进展中的与脂代谢相关的关键基因，分析脂肪酸结合蛋白1(FABP1)在其中可能发挥的作用机制。方法：于TCGA下载精原细胞瘤测序及临床数据，同GSEA网站下载脂代谢相关基因集共同分析，筛选出Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅰ期之间的与脂代谢相关的差异基因（MRGs）及关键基因FABP1，利用免疫组化对其表达进行验证，分析其与MRGs表达的相关性、甲基化水平、免疫浸润程度及对预后的影响。结果：Ⅱ期、Ⅲ期精原细胞瘤存在61个上调、4个下调的MRGs。FABP1与差异显著的MRGs有较强的相关性（P<0.01）,GK2、AWAT2、DGAT2L6、ELOVL3在多个甲基化探针均表现明显的甲基化（r=-0.744～-0.489，均P<0.001）。FABP1与自然杀伤细胞（NK细胞）、中央记忆型T细胞（Tcm细胞）、辅助性T细胞（Th细胞）均存在显著的相关关系（均P<0.01）；不同FABP1表达的样本中具有明显的免疫浸润（P<0.001）及基质成分（P<0.01）差异。高表达FABP1则能显著降低患者无进展生存期。结论：FABP1作为脂代谢关键基因，可能与其他MRGs通过共表达，改变自身甲基化及组织免疫浸润水平，共同促进精原细胞瘤的进展。

• 单位
  天津医科大学第二医院; 天津市泌尿外科研究所