伪狂犬病病毒Ⅱ型感染PK-15细胞的转录组学分析

作者：李海敏; 俞天奇; 金玉兰; 顾金燕^*; 周继勇

来源：农业生物技术学报, 2021, 29(10): 2008-2015.

• 伪狂犬病病毒Ⅱ型(PRVⅡ)
• 高通量测序
• 差异转录组

伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus, PRV)感染猪(Sus scrofa)可引起烈性接触性传染病,即伪狂犬病(Pseudorabies, PR),临床上主要通过疫苗免疫进行防控。PRV变异株(PRVⅡ型)的流行使传统疫苗失去有效保护。近年来出现PRV跨宿主感染人(Homo sapiens)的案例,更使PRV成为全球公共卫生威胁,但其感染致病机制仍不完全清楚。为从分子水平上全面了解PRV感染宿主细胞引起的变化,本研究以PRVⅡ型毒株PRV-DX感染猪肾细胞PK-15,通过高通量测序获得PRV感染后全部的细胞差异转录组数据,并对差异表达基因进行功能富集。结果表明,PRV-DX感染PK-15可引起3 595条基因表达上调、3 604条基因表达下调。通过qPCR验证随机选择的12条差异表达基因,其变化趋势与转录组数据一致。GO注释和KEGG信号通路富集将差异表达基因聚焦在代谢、基因表达、免疫等信号通路。本研究为深入解析PRV感染的致病机制提供了重要基础数据及研究方向。

• 单位
  浙江大学