基于DNA条形码技术对青海鼠疫疫源地内主要媒介蚤的分子鉴定研究

作者：马英; 李海龙; 何建; 赵延梅; 杨汉青; 鲁亮^*; 刘起勇

来源：中华地方病学杂志, 2018, 37(07): 532-535.

• 蚤目
• 细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ
• DNA条形码技术

目的应用DNA条形码技术对青海省鼠疫疫源地内主要媒介蚤进行分子鉴定,弥补蚤类传统形态分类方法的不足。方法于青海省3个州、2个市、5个县采集36份蚤种肌肉组织,PCR方法扩增细胞色素c氧化酶亚基I (CO I)基因片段并进行测序和比对;用Mega 6软件(K2-P双参数模型)计算种内及种间遗传距离,以邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统发育树。结果共测得2总科4属6种媒介蚤36条CO I基因部分序列。全部蚤种平均遗传距离为0.119。细钩盖蚤种内遗传距离最小(0.002),斧形盖蚤最大(0.027)。斧形盖蚤和细钩盖蚤的种间遗传距离最小(0.039),人蚤和细钩盖蚤距离最大(0.207)。种间遗传距离显著大于种内遗传距离。NJ树显示,同一物种的不同个体均形成高支持率的单系,种间分支明显。结论DNA条形码技术适用于青海省鼠疫疫源地内主要媒介蚤种的分子鉴定,可弥补蚤类传统形态分类方法的不足。

• 单位
  青海省地方病预防控制所; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所