结肠腺癌免疫预后基因的开发与验证

作者：向瑶; 周伟弘; 王桃丽; 王俊普^*

来源：实用肿瘤杂志, 2022, 37(02): 163-170.

DOI：10.13267/j.cnki.syzlzz.2022.026

• 结肠腺癌
• 免疫预后基因
• 风险评分

目的 发掘结肠腺癌（colon adenocarcinoma,COAD）免疫预后标志物并精准预测COAD生存风险。方法 从癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库下载COAD患者的临床信息以及RNA-seq数据，获取差异的免疫相关基因（differential immune related gene,DEIRG）。利用单变量和多变量Cox比例风险回归模型鉴定具有预后价值的免疫基因构建模型。利用Kaplan-Meier法分析模型中高风险和低风险患者的生存状态，并使用受试者操作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线评估该风险评分模型的准确度，并且从样本中随机抽取70%的病例作内部验证。采用单因素和多因素Cox回归分析，确定COAD的独立预后因素。结果 利用单因素和多因素Cox比例风险回归分析确定载脂蛋白12(lipocalin 12,LCN12)、嗜铬素A(chromogranin A,CHGA)、抑制素β亚基（inhibin subunit beta B,INHBB）、R3H域包含像（R3H domain containing like,R3HDML）和黑皮质素1受体（melanocortin 1 receptor,MC1R）为COAD患者预后风险模型中的5个风险基因（均P<0.05），对该模型进行风险评分，高风险组患者总生存时间较低风险组短（P=0.007），在随机抽取的内部测试组中得到验证，高风险组患者预后较低风险组差（P=0.028）。风险评分预测1年和3年总生存的ROC曲线下面积（area under curve,AUC）为0.715和0.683，内部验证组ROC AUC分别为0.736和0.673。单因素和多因素Cox分析显示，在实验组及内部验证组中风险评分是COAD的独立预后因素（P<0.01）。结论 开发并验证的COAD免疫预后基因LCN12、CHGA、INHBB、R3HDML和MC1R可提高COAD筛查及诊断效率，并对鉴定高或低生存风险的COAD患者亚组的治疗具有意义。

• 单位
  中南大学; 基础医学院; 中南大学湘雅医院; 株洲市中心医院