产蛋和停产武定鸡卵巢转录组SNP分析

作者：吴梦; 杨明; 马琳; 叶绍辉^*

来源：中国家禽, 2020, 42(03): 8-12.

DOI：10.16372/j.issn.1004-6364.2020.03.002

• 武定鸡
• 卵巢
• SNP
• GO富集
• KEGG富集

为提高武定鸡生产性能,探索繁殖相关差异基因,对270日龄产蛋和停产一周以上的武定鸡卵巢组织进行转录组测序,将获得的数据进行SNP检测,利用GO富集和KEGG富集分析SNP所在基因。结果显示:产蛋武定鸡特有的SNP有116 235个,停产武定鸡特有的SNP有156 020个,两者共有的SNP有276 467个;GO富集分析发现,SNP所在基因大量富集在生物进程中;KEGG富集分析发现,SNP所在基因显著富集在代谢途径、剪接、细胞周期、细胞凋亡、基础转录因子等通路;对GnRH信号通路中的5个基因SNP分析发现,有9个SNP位于外显子区,其中有4个SNP位于编码区并引起了氨基酸的改变。研究结果为武定鸡繁殖性能的相关研究提供了理论依据。

• 单位
  云南农业大学