胃癌缺氧和免疫相关预后模型的建立

作者:张瑶; 姜昕菊; 杨朔; 张磊*
来源:国际免疫学杂志, 2023, 46(04): 386-390.
DOI:10.3760/cma.j.issn.1673-4394.2023.04.005

摘要

目的构建缺氧和免疫相关风险评分模型来预测胃癌(gastric cancer, GC)患者的预后。方法通过无监督共识聚类算法生成两个不同的低氧聚类和免疫聚类, 基于哈尔滨医科大学-GC队列使用LIMMA包分析筛选出2227个缺氧相关和2640个免疫相关的胃癌差异表达基因。单变量Cox回归生存分析结合LASSO-Cox回归确定5个缺氧和免疫相关特征预后基因(FAIM2、CMA1 、MMP12、C11orf53、FBLN5)并构建风险评分模型。结果构建的缺氧和免疫相关预后特征基因是GC预后的独立因素(P<0.001), 并进一步构建预后模型。通过基因富集分析这些特征基因的生物学功能。通过CIBERSORT算法分析免疫差异。结论确定了一种针对缺氧和免疫相关预后特征可用作对GC风险进行分层的方法。

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