明清时期巢湖流域疫病年数共计36年。疫病流行是自然环境与气候特征、自然灾害和社会变迁等综合作用之结果。从自然环境看，疫病流行受明清宇宙期整体气候和流域内独有环境特征之双重影响；从自然灾害与疫病流行看，灾害元素联系与作用构成的灾害系统形成了疫病流行的大环境，其中，水、旱、蝗灾害元素与疫病形成的关系最直接；从社会因子与疫病流行看，疫病流行最能反映国家防疫力度、人口变迁、经济发展、战争和灾荒等影响因子综合作用所发生的效应。多种因子综合作用构成了疫病流行的生态场域。
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