树鼩干扰素家族的基本构成及分子特征分析

作者：李明利; 田巍威; 高跃东; 郭彦; 黄京飞; 张华堂

来源：动物学研究, 2012, (01): 67-74.

• 树鼩
• 干扰素
• 大片段核酸序列比对
• 基因预测 Tree shrews
• Interferon
• Whole genome sequence alignment
• Gene prediction

干扰素(IFN)是在"危险信号"刺激下,由细胞分泌的具有抗病毒、抗肿瘤、抑制细胞增殖和免疫调节等多重作用的糖蛋白家族,在机体免疫系统中具有重要地位。树鼩作为多种人类疾病研究模型的前景已受到广泛关注,但对其IFN家族的研究尚属空白。该研究在现有的树鼩全基因组数据基础上,应用大片段核酸序列比对、基因预测等方法,对树鼩IFN家族的基本构成和分子特征进行预测和分析。结果显示,树鼩具有I型IFN:α(5个亚型)、β、ω、κ、ε、δ;II型IFN-γ;III型IFN:IFN-λ1、λ2/3,所编码的氨基酸序列及蛋白空间结构与其它哺乳动物具有较高的相似性,但在半胱氨酸位置和N糖基化个数上具有部分差异。该研究...

• 单位
  中国科学院; 中国科学院研究生院; 中国科学院昆明动物研究所; 西南大学; 遗传资源与进化国家重点实验室