基于分子对接法的硝基PAHs与α-淀粉酶的相互作用

作者：张静; 蔡心如; 刘巧畅; 何毅聪

来源：泉州师范学院学报, 2022, 40(05): 1-6.

DOI：10.16125/j.cnki.1009-8224.2022.05.004

• α-淀粉酶
• 硝基多环芳烃
• 分子对接
• 相互作用

选取芘(PYR)及5种典型的NPYRs,利用分子对接方法研究其与α-淀粉酶之间的相互作用.结果表明：6种小分子在该酶中的结合位点较为分散，多为靠近α-淀粉酶的分子内部区域，但6种小分子在整个区域中的分子朝向、发生作用的氨基酸残基均存在差异；6种小分子与α-淀粉酶的亲和力的强弱顺序为1-硝基芘(1-NPYR)<1,3-二硝基芘(1,3-DNPYR)<1,8-二硝基芘(1,8-DNPYR)<1,6-二硝基芘(1,6-DNPYR)<2-硝基芘(2-NPYR)<PYR;6种PAHs主要依靠疏水作用力与α-淀粉酶结合，此外1,3-DNPYR和1,6-DNPYR与α-淀粉酶之间还存在π-π堆积作用，1-NPYR与α-淀粉酶间还存在氢键作用力及水桥连接，而1,3-DNPYR、1,6-DNPYR、1,8-DNPYR和2-NPYR与α-淀粉酶间还存在较强的静电作用.疏水作用、静电作用和取代基个数、位点等分子构型差异均是影响NPYRs与α-淀粉酶结合的重要因素.

• 单位
  厦门大学嘉庚学院; 煤炭科学技术研究院有限公司