SSX基因家族HLA-A2.1限制性CTL表位预测及其MHC-Ⅰ亲和力分析

作者：何仰东; 吴玉章; 林治华; 贾正才; 姜曼; 黎万玲; 付晓岚; 邓一静; 倪兵

来源：第三军医大学学报, 2006, (09): 872-875.

• SSX肿瘤基因
• 表位预测
• HLA-A2.1限制性
• 结合亲和力

目的通过对肿瘤基因SSX家族不同成员进行CTL表位预测,并对其与MHC-Ⅰ亲和力进行分析,为探索基于SSX肿瘤基因家族的免疫治疗奠定基础。方法利用基于超基序结合量化基序方案开发的HLA-A2.1限制性CTL表位预测软件,对SSX基因家族不同成员进行CTL表位预测,然后合成SSX相关待测表位肽P1(AMTKLGFKA)、P4(AMT-KLGFNV)、P5(AMTKLGFKV)和P6(VMTKLGFKV),再对这些合成肽与MHC-Ⅰ结合亲和力及其结合物稳定性进行实验分析。结果与实验阳性肽(HBcAg,18~27)相比,除P1外,P4、P5、P6均显示较高的结合亲和力;而结合稳定性实验(DC50)结果显示,P1、P4与阳性对照肽(HBcAg,18~27)DC50均大于8 h,而P5和P6的DC50介于2~4 h之间。结论计算机软件预测的CTL表位肽,经过体外亲和力与结合稳定性实验筛选到2条理想的表位肽,为该表位的下一步体内鉴定奠定基础。

• 单位
  生物工程学院; 第三军医大学; 重庆理工大学