贲门癌中长链非编码RNA和微小RNA差异表达谱及相关性分析

作者：杨俊强; 胡晓辰; 齐义军; 高社干

来源：郑州大学学报(医学版), 2018, 53(01): 10-13.

DOI：10.13705/j.issn.1671-6825.2017.03.043

• 贲门癌
• 基因芯片
• 生物信息预测
• 长链非编码RNA
• 微小RNA

目的:分析贲门癌与癌旁组织中长链非编码RNA(lncRNA)和微小RNA(miRNA)的差异表达谱及二者的相关性。方法:利用基因芯片技术鉴定15例贲门癌与癌旁组织中的lncRNA及miRNA的差异表达谱,生物信息方法分析与H19相互作用的候选miRNA分子,qRT-PCR验证H19和miR-148a-3p在贲门癌中表达的相关性。结果:15例贲门癌与癌旁组织中鉴定出5倍以上差异性表达的lncRNA 182个,2倍以上差异性表达的miRNA 152个。生物信息学预测结果表明,lncRNA H19与7个miRNA表达具有相关性。qRT-PCR验证37例贲门癌与癌旁组织中H19和miR-148a-3p的表达呈负相关(r=-0.398,P<0.001)。结论:贲门癌中差异表达的lncRNA和miRNA分子参与了癌变过程,H19可能直接调控miR-148a-3p的表达。

• 单位
  河南科技大学第一附属医院; 河南科技大学