系统性硬化症伴间质性肺病的潜在标志物和治疗靶点

作者：黄碧青; 李菁^*

来源：中华临床免疫和变态反应杂志, 2021, 15(03): 245-256.

• 系统性硬化症
• 间质性肺病
• 差异表达基因
• 标志物
• 治疗靶点

目的通过分析系统性硬化症伴间质性肺病(systemic sclerosis with interstitial lung disease, SSc-ILD)患者与健康对照肺组织基因表达情况,筛选出SSc-ILD的潜在标志物和治疗靶点,并探究其参与SSc-ILD的可能发病机制。方法计算2个芯片(GSE76808、GSE81292)中的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),取2个芯片共同表达的DEGs,对其进行功能注释、功能富集和蛋白质相互作用网络分析。CTD、GENE和DisGeNET数据库验证SSc-ILD的相关基因。结果 2个芯片共同表达的DEGs 230个,其中59个基因表达上调,171个基因表达下调。CTD数据库中与SSc和ILD存在关联的基因10 694个;GENE数据库中与SSc和ILD存在关联的基因50个;DisGeNET数据库中与SSc有关的基因980个。结合芯片和3个数据库分析结果,IL-6、CXCL8、CCL2、IL-1B、ICAM1、JUN、PTGS2、TNFAIP3可能是SSc-ILD的潜在标志物和治疗靶点。结论 IL-6、CXCL8、CCL2、IL-1B、ICAM1、JUN、PTGS2、TNFAIP3可能参与了SSc-ILD的发病机制,有望作为SSc-ILD的潜在标志物和治疗靶点。

• 单位
  中国医学科学院北京协和医学院; 北京协和医院