siRNA序列特征的RNA干扰效率预测的新方法

作者：徐宝林; 于大川; 高冬; 张浩; 刘元宁

来源：吉林大学学报(信息科学版), 2011, (05): 436-443.

• RNA干扰
• 干扰效率预测
• 序列特征
• 统计学分析 ribonucleic acid interference(RNAi)
• prediction of interference efficiency
• sequence characteristic
• statistical analysis

为了快速、准确预测siRNA(Small interfering Ribonucleic Acid)的干扰效率,通过对2 431条siRNA的统计学分析找到了一个可靠的预测新方法。通过统计学方法从众多特征中筛选出了19个与siRNA抑制效率相关的序列特征,并用这些特征给出了siRNA抑制效率水平的聚类方法,准确率达到81.1%。该方法将对高效的siRNA设计起到指导意义。

• 单位
  吉林大学第一医院; 吉林大学