地黄花叶病毒河南分离物检测鉴定及其MP序列分析

作者：郭枭; 冯陈尉; 庄新建; 丁诗文; 董卓倬; 贺振; 张坤^*

来源：扬州大学学报（农业与生命科学版）, 2022, 43(03): 102-107.

DOI：10.16872/j.cnki.1671-4652.2022.03.016

• 地黄
• 地黄花叶病毒
• 检测方法
• 基因克隆
• 序列分析

2019年夏，在河南温县中草药园内发现种植的地黄呈现疑似病毒侵染所表现出的褪绿、花叶等症状，采集该样品，用Trizol法提取地黄样品总RNA,分离其siRNA,并进行文库构建和siRNA高通量测序。将测序结果经接头去除、拼接组装后(Velvet Software 0.7.31,k=17),与NCBI数据库中序列进行核酸比对分析，发现该样品中存在着地黄花叶病毒(Rehmannia mosaic virus, ReMV)和瓜类褪绿黄化病毒(cucurbit chlorotic yellows virus, CCYV)的部分片段。通过RT-PCR确认该样品存在ReMV的侵染，使用商业化的ELISA试剂盒进一步确认该样品被ReMV侵染过。进一步克隆ReMV河南分离物的MP序列，并结合NCBI数据库中发布的该病毒MP序列，构建了基于MP序列的ReMV河南分离物系统发育树。该研究丰富了ReMV群体的传播范围及其基因组遗传信息，为后续ReMV的深入研究奠定了基础。

• 单位
  扬州大学; 园艺与植物保护学院