R语言程序包在SNP相关疾病关联性荟萃分析中的应用与功能介绍

作者：门致雨; 王鑫; 朱琍燕^*

来源：科技风, 2023, (14): 165-168.

DOI：10.19392/j.cnki.1671-7341.202314055

• SNP
• 荟萃分析
• 统计软件
• R语言

目的：SNP与疾病关联性研究的荟萃分析是近几年常见的研究类型。本文重点关注此类研究相关软件的使用情况，并对R语言中用于此类分析常用程序包的功能及使用方法作一简单介绍。材料方法：(1)通过检索中国知网2010年、2015年、2020年、2021年及2022年发表的SNP疾病关联性荟萃分析的研究论文，分析相关统计软件的使用频次；(2)统计了全球用于荟萃分析的R语言程序包下载情况；(3)最后结合相关资料对meta包及metafor包使用方法作了简单介绍。结论：(1)Stata与RevMan是此类研究中最常用的软件，R语言出现时间晚，使用次数少；(2)近年全球荟萃分析相关R程序包使用增长迅速，meta包及metafor包为其中的核心程序包；(3)meta包及metafor包均可实现SNP与疾病关联性研究的荟萃分析，metafor包功能全面，meta包使用简便，后者更适于初学者进行学习。

• 单位
  苏州大学