基于RAD高通量测序的蓝花楹群体遗传分析

作者：刘学锋; 李小梅; 张国武^*; 张沛健; 刘果; 黄敏; 陈银霞

来源：热带亚热带植物学报, 2022, 30(05): 613-622.

• 蓝花楹
• RAD-seq
• 遗传多样性
• 群体遗传

为了解蓝花楹(Jacaranda mimosifolia)种质资源的遗传多样性和群体遗传结构，对168份种质材料进行RAD-seq测序，构建了系统进化树并进行主成分、群体结构和遗传多样性分析。结果表明，比对参考基因组平均比对率为81.02%，平均测序深度23.18×，最终获得45 552个高质量的SNPs。群体遗传结构分析表明，供试蓝花楹可划分为2个大的类群，来自川、渝地区的种质材料基本归为一类；其余地区归为另一类。19个地区的蓝花楹在SNP水平上的遗传多样性较高，云南昆明(YNKM)居群的核苷酸多样性(π)和期望杂合度(He)最大，表现出最高的遗传多样性。因此，来自川、渝地区的蓝花楹具有相对较近的亲缘关系，推断来自同一祖先，而其余地区的种质可能是随机引种栽培。

• 单位
  广东海洋大学寸金学院; 中国林业科学研究院