朝仓花椒CBL基因家族的鉴定及分析

作者：王作日; 王超; 赵懿琛^*; 赵德刚

来源：种子, 2020, 39(11): 31-37.

DOI：10.16590/j.cnki.1001-4705.2020.11.031

• 朝仓花椒
• CBL基因家族
• 生物信息学分析

通过NCBI BLAST分析,从朝仓花椒转录组中鉴定获得31条朝仓花椒类钙调磷酸酶B亚基蛋白(Calcineurin B-like protein,CBL)家族的编码基因序列,将其命名为ZpCBL 1-ZpCBL 31。对该基因家族进行分析发现,朝仓花椒的CBL基因家族在进化上可分为4组,每组成员数量分别为16、8、5、2。该家族蛋白等电点均小于7,偏酸性,且较多数为不稳定蛋白。多基因序列比对可知朝仓花椒CBL家族均具有至少1个高度保守的EF-hand结构域。对空间结构的分析发现,ZpCBL蛋白为多链折叠蛋白,以α螺旋为主。

• 单位
  贵州大学; 生命科学学院; 贵州省农业科学院